Emi Makaze uzun zaman önce kaybolan kardeşinin bulunması için City Hunter’dan yardım ister. Ryo ilk kez bir bayandan gelen iş teklifini geri çevirir. İşi Kaori kabul eder; ne de olsa uzun zamandır gelen tek iş budur.
Takma adı "Profesör" olan eski bir asker, havaalanından giriş yapar. Saeko bütün yeteneğini kullanır ama Profesör’ü elinden kaçırır; ancak, toplamış olduğu istihbaratlar sayesinde Profesörün ne planladığını az da olsa tahmin eder. Tokyo büyük bir tehlike altındadır ve yardım istenebilecek tek bir kişi vardır: Ryo Saeba!