Test aşamasında olan bir tür zoanoid yanında taşıdığı 3 Guyver ünitesiyle birlikte Chronos şirketi ve adamlarından kaçmaya çalışır. Yakalanacağını anlayınca yanında taşıdığı bombayı havaya uçurur. Patlamadan sağ çıkamaz fakat Guyver üniteleri de çevreye dağılmıştır.
Ünitelerden birini Chronos askerleri bulur fakat diğer ikisi hala kayıptır. Bu arada Sho Fukamachi ve Tetsuro Segawa oradan geçmekte olan iki lise öğrencisidir. Patlamanın olduğu bölgeye yakın oldukları için Guyver ünitelerinden birini bulurlar. Sho, bilmediği bu yabancı cismi incelerken farkında olmadan onu aktive eder. Birden cisimden çıkan kollar onu sararak nehre düşmesine sebep olur. Bu sırada Chronos askerleri Tetsuro'nun çevresini sarmış ve onu öldürmek üzeredir. Aniden Sho nehirden çıkarak arkadaşını kurtarır: Artık yaşayan bir canlı olan Guyver ile birleşmiştir.
Sho bundan sonra arkadaşlarını ve tüm dünyayı şeytani Chronos şirketi ve onun yarattığı zoanoid adı verilen canavarlardan korumak zorunda kalacaktır.
01. The Wondrous Bio-Boosted Armor
02. The Secret Society of Chronos
03. Inspector Lisker
04. The Visitor at Dusk
05. The Third Shadow
06. Beyond the Desperate Battle
07. The Miraculous Cell
08. Shuddering Skyscraper
09. Ash and Memories
10. Prelude to the Chase
11. Relic`s Point
12. To Each His Own Resolution
13. The Tragic Enzyme II
14. Escape in the Rain
15. Guyot Joins the Fray
16. Arise, Guyver I
17. Nightmarish Encirclement
18. Vibrations
19. The Night Before the Final Assault
20. The Creators` Ship
21. Relic`s Point in Disarray
22. Countdown to Collapse
23. Ray of Annihilation
24. In the City Under Oppression
25. Hatching Pupa
26. Descending!! Gigantic
