Garip bir olay, Sakura Kinimoto’yu kaybolmasına neden olduğu Clow Kartlarını, dünyaya felaket getirmeden önce tekrar toplaması için Card Captor Sakura’ya çevirir. Bu olay, ufaklığın ve çevresindekilerin hayatlarını değiştirecek olaylar zincirinin ilk halkasıdır. Sakura'nın annesi, o çok küçükken vefat etmiştir. Sakura, babası ve onunla sürekli uğraşan abisi Touya ile birlikte yaşamaktadır. Abisinin en yakın arkadaşı olan Yukito'ya da derinden bir aşkla bağlıdır. Clow kartlarını yakalamak isteyen bir tek Sakura değildir. Clow ile aynı soydan gelen Syaoran'ın, Hong Kong'dan Japonya'ya gelmesiyle olaylar daha da eğlenceli bir hal alır.