Bu hikaye Neon Genesis Evangelion serisinin alternatif bir anlatımıdır ve her şey asıl hikayeden farklıdır: Shinji ve Asuka çocukluk arkadaşları olarak büyümüşlerdir, Kaoru onlarla aynı okula gitmektedir, Rei okuldaki yeni öğrencidir, Ritsuko okulun hemşiresi, Misato da öğretmenleridir. NERV ise deneyleri için gençleri bir araya toplamaktadır ve ikinci darbe hiç olmamıştır.
Bu alternatif hikaye aksiyondan çok, aşk üçgenleri ile dolu romantik bir seri olarak gelişiyor.
