"Uzun zaman önce Alto Mare denen bir adada, yaşlı bir adamla kadın yaşarmış. Bir gün bunlar, sahilde iki yaralı çocuk bulmuşlar. Bu yaşlı çift, onların iyileşmesine yardım etmiş. Fakat aniden şeytani bir varlık belirmiş ve şehre saldırmış. Şehrin insanları, bu canavardan korkuyormuş. Fakat sonra bu yaşlı çiftin gözleri önünde iki çocuk değişime uğramışlar. Efsanevi Pokémonlar olan Latios ve Latias'a dönüşmüşler. Arkadaşlarını çağırıp canavarı yenmek için güçlerini birleştirmişler. Bu güç 'Soul's Drip' denilen mücevherdeymiş. Ada yeniden barışa kavuşmuş. Latias ve Latios 'Soul's Drip' in bulunduğu bu adaya tekrar döneceklerdir."
Ash ve arkadaşları bu sefer Alto Mare adasındalar. Annie ve Oakley, efsanevi pokemonlar Latios ve Latias'ın peşindeler ve bir de 'Soul's Drip' denilen çok büyük güce sahip olan mücevheri aramaktadırlar. Ash ve arkadaşları, onları durdurabilmek için ellerinden gelenin en iyisini yapmak zorundadırlar...
